26 февраля 1950 г. в соответствии с постановлением Совета Министров СССР было создано Управление строительства «Сибхимстрой» для возведения Горно-химического комбината в Железногорске. Уже в августе 1950 г. были сформированы первый военно-строительный полк в/ч 0601 численностью в три батальона и одна авторота, начались горные работы. Численность всех работающих в первый год строительства составила 10 182 человека. Наряду с гужевым транспортом использовались 12 экскаваторов, 12 бульдозеров и 336 автомобилей.
В 1950 г. был создан деревообрабатывающий комбинат, в 1951 г. запущены первая очередь бетонного завода и полигоны по изготовлению железобетона. В марте 1952 г. организован район строительства и эксплуатации в составе завода шлакоблочных изделий, известкового и бетонного заводов, карьеров по добыче песка и гравия.
Одновременно со строительством промышленных объектов ударными темпами велось строительство объектов жилья и всей инфраструктуры Железногорска, а с 1969 г. — и Сосновоборска.
В 1961 г. в состав управления вошел домостроительный комбинат для изготовления и монтажа домов серии 1–335, так называемых хрущевок.
В 1976 г. был принят первый генеральный план Железногорска. В начале 1960-х гг. первый микрорайон уже получил свои очертания, в 1968-м строители приступили к возведению второго, а в 1976-м — третьего микрорайона. Каждый микрорайон — это около 100 тыс. кв. м жилья.
1970—1980 гг. — период расцвета предприятия. За эти годы были построены изотопно-химический завод на Горно-химическом комбинате, красноярские заводы «Сибэлектросталь» и «Красмаш», телевизионно-спутниковый ретранслятор «Орбита», завод «Сибтяжмаш», экспериментально-производственный корпус ГОСНИТИ (Всероссийского научно-исследовательского технологического института ремонта и эксплуатации машинно-тракторного парка), химико-металлургический завод, завод по производству холодильников «Бирюса», Новоенисейский лесодеревоперерабатывающий комбинат в Лесосибирске, химкомбинат в Северске Томской области, Сосновоборский завод автоприцепов, Приаргунское производственное горно-химическое объединение в Краснокаменске Читинской области, Игналинская АЭС в Литве (Висагинас). Управление принимало участие в строительстве Ленинградской АЭС и города Сосновый Бор. Кроме того, построен город Железногорск на 110 тыс. жителей, Сосновоборск на 50 тыс., миллионы квадратных метров жилья в микрорайонах Красноярска, жилье и животноводческие комплексы в районах Красноярского края.
После аварии на Чернобыльской АЭС 26 апреля 1986 г. 168 сибирских строителей находились в эпицентре, выполняя работу по устранению последствий.
В 1990-х гг. предприятие переживало сложный период. Строительство РТ-2 (завод по переработке отработавшего ядерного топлива) законсервировали, все жилищные программы были свернуты. В 1994 г. полностью прекратили строить дома за счет предприятия. Средств на содержание социальной инфраструктуры не было. В сентябре 1991 г. Управление строительства «Сибхимстрой» реорганизовано в строительно-промышленное акционерное общество «Сибхимстрой», в октябре 2000 г. — в ООО «Атомстрой».
В апреле 2002 г. ООО «Атомстрой» было включено в состав Управления специального строительства по территории № 8 Спецстроя России, а с января 2003 г. преобразовано во ФГУП «УССТ № 9 при Спецстрое России». В 2000-х гг. у предприятия появились крупные оборонные заказы, качественно обновился парк автотехники и материально-техническая база, возобновилось жилищное строительство.
Одним из основных объектов возрожденного управления стало строительство первого пускового комплекса «сухого» хранилища отработавшего ядерного топлива (ОЯТ) реакторов РБКМ-1000 и ВВЭР-1000 на Горно-химическом комбинате.
В связи с остановкой реактора АДЭ-2 на ГХК, который помимо военной функции использовался также для обогрева Железногорска, возникла необходимость построить ТЭЦ между Сосновоборском и Железногорском. Силами специалистов управления строительства была проведена инженерная подготовка площадки, построены центральная насосная станция, подводящий канал системы охлаждения оборудования, система топливного хозяйства, магистральная теплотрасса от Сосновоборска до Железногорска. В то же время, пока строительство ТЭЦ не завершено, работники УССТ № 9 построили и сдали в эксплуатацию котельную № 1 для Горно-химического комбината, которая взяла на себя функцию жизнеобеспечения Железногорска.