В период войны Краевая библиотека организовывала передвижные книжно-иллюстративные выставки, работники библиотеки выезжали в села края с лекциями.
В экстремальных условиях военного времени продолжалась работа Государственной универсальной научной библиотеки Красноярского края. Она обслуживала читателей, комплектовала новую литературу, выписывала общесоюзные, краевые и районные периодические издания, такие как «Правда», «Труд», «Известия», «Красноярский рабочий», «Красноярский железнодорожник» и др. В библиотеке не прекращалась работа по сохранности библиотечного фонда.
Краевая библиотека перестроила свою работу соответственно задачам военного времени. Многие сотрудники библиотеки были призваны в ряды РККА и воевали на фронтах Великой Отечественной войны, а оставшиеся работать в библиотеке по решению крайкома ВКП(б) «О привлечении населения к трудовой повинности» направлялись на предприятия, в колхозы, на лесозаготовки.
В библиотеке был наполовину сокращен штат, отменены очередные отпуска, помещения библиотеки часто не отапливались. Приказ директора библиотеки обязывал весь коллектив изучать военное дело.
Несмотря на трудные условия работы, библиотека в годы войны не закрывалась ни на один день. Посещаемость библиотеки была на удивление высокой. Жесткая дисциплина военного времени не допускала и минутных опозданий на работу. Больше, чем в мирное время, ценились взаимопомощь и взаимовыручка.
О напряженности работы тех лет можно судить по таким цифрам: в 1943 г. в библиотеку записалось 3 297 читателей, книговыдача составила 32 371 единиц хранения, посетили библиотеку 43 843 человека. В последний год войны в библиотеке возросло количество читателей, их стало 5 960.