Медведь на гербе Северо-Енисейского района аллегорически показывает лучшие качества местных жителей, а лопата символизирует труд золотодобытчиков.
Издавна земли, составляющие территорию современного Северо-Енисейского района, славились природным богатством и разнообразием. В гербе это символически отражено сочетанием золота и зеленого цвета и фигурами двух медведей. Медведь — хозяин леса, традиционный символ благородства, силы, величия, трудолюбия и упорства, аллегорически показывает лучшие качества местных жителей.
Геральдическое описание герба гласит: «В лазоревом поле два золотых восстающих сообращенных медведя, стоящих на узкой включенной зеленой оконечности; правый держит в передних лапах золотые стрелу и лук, левый — таковую же лопату концом вниз; во главе медведи сопровождены золотым сиянием наподобие звезды с лучами без числа».
Золото (желтый цвет) — символ урожая, богатства, стабильности, уважения, тепла и жизненной энергии, а также драгоценного металла золота, добыча которого традиционно ведется в Северо-Енисейском районе на протяжении многих десятков лет.
Лазурь (голубой цвет) — символ чести, благородства, духовности, возвышенных устремлений, цвет водных просторов, бескрайнего неба, а также снежных покровов, обилие которых характерно для Северо-Енисейского района, относящегося к районам Крайнего Севера.
Зеленый цвет — символ природы, здоровья, молодости, роста, возрождения и обновления, а также просторов сибирской тайги.
Орудия, которые держат звери, отражают основные и традиционные занятия местного населения: лук и стрелы взяты из исторического герба Сибирского царства, подчеркивают историческую преемственность поколений и также аллегорически указывают на развитые в районе охотхозяйства; лопата символизирует труд золотодобытчиков.
Символику приисков дополняет золотое сияние в виде звезды без определенного числа лучей.
Флаг Северо-Енисейского района представляет собой прямоугольное голубое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, с зеленой полосой вдоль нижнего края и гербовой композицией.
Герб и флаг Северо-Енисейского района утверждены решением районного Совета депутатов 23 сентября 2011 г. Официальные символы внесены в Государственный геральдический регистр Российской Федерации, записи № 7199 и № 7200.