Красная искра в гербе Шушенского района символизирует место трехлетней ссылки вождя Октябрьской революции, а снежный барс — уникальный животный мир.
Геральдическое описание герба Шушенского района гласит: «В зеленом поле на золотом скалистом берегу над лазоревыми (синими, голубыми) водами — сидящий и обернувшийся серебряный барс; по сторонам с берега в воды льется по два лазоревых потока; в серебряной главе щита — выходящая червленая (красная) искра (в виде звезды о трех видимых лучах, между которыми возникает два малых луча)».
Герб района языком знаков и символов отражает исторические, природно-географические и экономические особенности территории.
Шушенский район был образован в 1944 г., однако его центр — село Шушенское — с 1920-х гг. получило широкую известность как место трехлетней сибирской ссылки В. И. Ленина, а в 1930 г. здесь был открыт музей вождя Октябрьской революции. В гербе это символически отображено красной искрой.
Снежный барс символизирует уникальный животный мир района, где сохранились нетронутые человеком участки горной тайги, на которых был создан государственный природный биосферный заповедник «Саяно-Шушенский».
Плотина Саяно-Шушенской ГЭС в верховьях Енисея, правым плечом упирающаяся в скалистые горы Шушенского района, отображена с помощью голубых потоков, ниспадающих с плотины, аллегорически изображенной золотыми скалами.
Золото в геральдике — символ величия, постоянства, интеллекта, великодушия, богатства. Серебро символизирует чистоту, благородство, мир, взаимопонимание.
Лазурь в геральдике — символ искренности, чести, славы, преданности, истины и добродетели. Зеленый цвет символизирует природу, надежду, весну и здоровье, а также указывает, что в районе основной отраслью производства является сельское хозяйство.
Флаг Шушенского района представляет собой прямоугольное полотнище зеленого цвета с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее гербовую композицию.
Официальные символы Шушенского района утверждены решением районного Совета депутатов 9 июля 2004 г., внесены в Государственный геральдический регистр Российской Федерации, записи № 1526 и № 1527.