К маю 1945 года на боевом счету гвардии капитана Трофимова было 376 боевых вылетов
Летчик, полковник авиации. Герой Советского Союза (1944). Заслуженный военный летчик СССР (1968).
Родился 14 марта 1920 года в селе Паспаул на Алтае. Умер в 1981 году в Армавире.
Окончил среднюю школу на станции Клюквенная (ныне г. Уяр) в Красноярском крае (1937), Борисоглебскую военную авиационную школу пилотов (1941), Военно-воздушную Академию.
В 1930-е годы вместе с родителями переехал на жительство в Красноярский край. В 1935 году вступил в ВЛКСМ в селе Каратуз. Окончил с отличием 10 классов средней школы в 1937 году на станции Клюквенная (ныне г. Уяр). С 1937 по 1938 годы работал инструктором физкультуры и спорта Манского райисполкома Красноярского края. В 1938 году поступил в Московский историко-архивный институт. В 1939 году без отрыва от учебы окончил школу снайперов при ЦС Осоавиахима в г. Москве.
В январе 1940 года во время финской войны снайпер и лыжник-перворазрядник Трофимов добровольцем ушел на фронт (призван Свердловским РВК Москвы). Он был командиром отделения, заместителем политрука роты, заместителем командира батальона по политической части 73-го лыжного батальона 94-го стрелкового полка 15-й стрелковой дивизии 8-й армии. За боевые отличия в марте 1940 года награжден орденом Красной Звезды.
Демобилизовавшись в апреле 1940 года, вернулся в институт и без отрыва от учебы в институте обучался на пилотском отделении аэроклуба Свердловского района г. Москвы. Окончив аэроклуб и три курса Московского историко-архивного института, в декабре 1940 года по спецнабору поступил в Борисоглебскую военную авиационную школу пилотов (ВАШП). После успешного окончания школы пилотов в сентябре 1941 года Евгению Трофимову было предложено поступить на курсы комиссаров эскадрилий при Смоленском военно-политическом училище. После окончания курсов с 20 января 1942 года политрук Трофимов стал «летающим комиссаром» — был назначен на должность военного комиссара эскадрильи 730 истребительного авиаполка 104 истребительной авиадивизии ПВО. С 14 января 1943 года старший лейтенант Трофимов исполнял обязанности командира эскадрильи в этом же полку, в июле 1943-го стал заместителем командира эскадрильи по политической части 910 ИАП особого назначения Западного фронта ПВО.
6 июня 1943 года командир 910 ИАП подполковник Терешкин представил старшего лейтенанта Трофимова к награждению орденом Красного Знамени: «… За время Отечественной войны имеет 310 боевых вылетов, сбил лично два самолета противника. Участвовал в воздушных боях при массовых налетах авиации противника на Курск, дерется смело и решительно. 2 июня 1943 года в воздушном бою сбил лично два самолета противника». Приказом войскам Западного фронта ПВО № 014 от 30.08.1943 г. старший лейтенант Трофимов был награжден орденом Красного Знамени.
С 22 февраля 1944-го и до конца войны гвардии капитан Трофимов служил в 148 Гвардейском истребительном авиаполку особого назначения Северного фронта ПВО, сначала заместителем командира эскадрильи – начальником отделения наведения, а с декабря 1944 года — командиром эскадрильи.
19 марта 1944 года, вылетев на отражение массированного бомбардировочного налета самолетов противника на железнодорожный узел и город Сарны, в воздушном бою с превосходящими силами противника Трофимов проявил смелость и отвагу, сбил два немецких бомбардировщика и был награжден вторым орденом Красного Знамени.
В районе Корсунь-Шевченковского гвардии капитан Трофимов провел 8 штурмовок наземных войск врага, в воздушных боях сбил 3 фашистских самолета и 1 уничтожил на земле, сжег 15 автомашин, 25 повозок с грузами, рассеял и уничтожил до роты гитлеровской пехоты.
Помощник штурмана 148-го Гвардейского истребительного авиационного полка (148-я истребительная авиационная дивизия, войска ПВО страны) гвардии капитан Трофимов к апрелю 1944 года в 20 воздушных боях сбил лично 14 и в группе 3 самолета противника. 20 апреля 1944 года гвардии капитан Трофимов был представлен к присвоению звания Героя Советского Союза. Указом Президиума Верховного Совета СССР от 22 августа 1944 года за образцовое выполнение боевых заданий командования на фронте борьбы с немецко-фашистскими захватчиками и проявленные при этом мужество и героизм гвардии капитану Евгению Федоровичу Трофимову присвоено звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали «Золотая Звезда».
К маю 1945 года на боевом счету гвардии капитана Трофимова было 376 боевых вылетов на истребителях МиГ-3, Як-1, Як-7 и Як-9. В 26 воздушных боях он сбил лично 17 и в группе 5 фашистских самолетов. К боевым орденам прибавились медали «За оборону Советского Заполярья» и «За взятие Берлина».
После окончания войны продолжил службу в авиации противовоздушной обороны. За выслугу лет был награжден орденами Красного Знамени, Красной Звезды и медалью «За боевые заслуги». Окончил с отличием Военно-воздушную Академию. Служил на командных должностях: инструктор-летчик по технике пилотирования авиадивизии, командир авиаполка, заместитель командира авиадивизии по летной подготовке, заместитель начальника авиации 14-й отдельной армии ПВО. С 1966 года полковник Трофимов — заместитель начальника, с 1970-го — начальник Армавирского высшего военного авиационного училища летчиков войск ПВО страны. Освоил более 20 типов реактивных и сверхзвуковых самолетов. В 1968 году полковник Е. Ф. Трофимов удостоен звания «Заслуженный военный летчик СССР».
Уволен в запас по возрасту в 1972 году. Жил в Армавире, работал преподавателем в ГПТУ № 5.
В поселке Паспаул имя героя носит улица и школа. Армавирскому ГПТУ № 5, в котором долгое время работал Трофимов, в 2004 году присвоено его имя.