После реорганизации в 1987 г. из состава больницы выделились поликлиника и женская консультация. В 1999 г. к больнице присоединились городские поликлиники № 9 и № 15. В 2011 г. к городской больнице № 1 присоединилась городская поликлиника № 13. В 2014 г. городская больница стала специализироваться на поликлинической помощи и была реорганизована в межрайонную поликлинику № 5. В медицинском учреждении трудятся более 500 человек. Возглавляет медучреждение доцент, кандидат медицинских наук Сергей Григорьевич Резниченко.
В 2000 г. на базе поликлиники № 1 открылась современная грязеводолечебница, в которой применяют методику лечения и реабилитации сапропелями озера Плахино.
В 2006 г. на базе поликлиники открыт городской эндокринологический центр по диагностике, лечению больных с заболеванием щитовидной железы. В 2011 г. на базе поликлиники № 2 был организован Центр здоровья.
В 2012 г. был открыт дневной стационар в хирургическом отделении. В клинико-диагностической лаборатории внедрены новые методики диагностики заболеваний, а современная аппаратура в рентген-отделении позволяет провести обследование и получить результат в течение 15—20 минут.
В поликлиниках открыты несколько терапевтических и хирургических отделений, офтальмологическое, неврологическое отделения, отделение профилактики, городской эндокринологический центр. Общее количество посещений в поликлиниках составляет около 500 тыс. пациентов в год.
Врачи Красноярской межрайонной поликлиники № 5 оказывают амбулаторно-поликлиническую помощь взрослым по нескольким направлениям: акушерство и гинекология, дерматовенерология, инфекционные болезни, неврология, отоларингология, офтальмология, терапия, гематология, кардиология, общая хирургия, онкология, сердечно-сосудистая хирургия, урология, эндокринология. Стационарная помощь оказывается по направлениям: общая терапия, неврология, общая хирургия.
Больница принимает участие в конкурсах «Лучший врач», «Лучший работник муниципальных учреждений здравоохранения». В 2011 г. врач-уролог Е. Ю. Хлебнова победила в конкурсе «Лучший работник муниципальных учреждений здравоохранения».
За заслуги в области здравоохранения награждены нагрудным знаком «Отличник здравоохранения» О. Г. Беззаботнова (2002 г.), С. Г. Резниченко (2007 г.), В. М. Каверина (1999 г.), Е. В. Крижановская (2007 г.), Е. А. Платонова (1986 г.).
Основной корпус Красноярской межрайонной поликлиники № 5 расположен по адресу: 660049, Красноярский край, город Красноярск, пр. Мира, 46.