Система законодательной и исполнительной власти региона выстроена в соответствии с основами конституционного строя Российской Федерации.

В систему органов исполнительной власти Красноярского края входят высшее должностное лицо региона — Губернатор Красноярского края, высший орган исполнительной власти региона — Правительство Красноярского края, министерства Красноярского края, службы Красноярского края, агентства Красноярского края, Региональная энергетическая комиссия Красноярского края, Постоянное представительство Красноярского края при Правительстве Российской Федерации, управление делами Губернатора и Правительства Красноярского края, мировые судьи Красноярского края.
Государственными органами края являются Избирательная комиссия Красноярского края, Счетная палата Красноярского края и Уполномоченный по правам человека в Красноярском крае.
Высшим и единственным органом законодательной власти региона является Законодательное Собрание Красноярского края.
Система органов законодательной и исполнительной власти региона закреплена в Уставе Красноярского края в соответствии с основами конституционного строя Российской Федерации и общими принципами организации законодательных (представительных) и исполнительных органов государственной власти субъектов РФ.
Органы государственной власти края формируются краем самостоятельно. Их система может быть изменена в пределах, допускаемых Конституцией и федеральными законами, путем внесения поправок в Устав края. Закон о внесении таких поправок вступает в силу не ранее чем по истечении срока полномочий Законодательного Собрания края, принявшего этот закон.
Органы местного самоуправления не входят в систему органов государственной власти. Полномочия муниципальных образований осуществляются опосредованно через соответствующие выборные и другие органы местного самоуправления.
В Красноярском крае работают три омбудсмена — по правам человека, по правам ребенка и по правам коренных малочисленных народов. Они призваны обеспечить гарантии государственной защиты прав и свобод человека и отдельных категорий граждан, их соблюдения и уважения государственными органами, органами местного самоуправления и должностными лицами. Кроме того, в 2013 году законом Красноярского края была учреждена государственная должность уполномоченного по защите прав предпринимателей. Цель его деятельности — обеспечение гарантий государственной защиты прав и законных интересов субъектов предпринимательской деятельности, соблюдения прав предпринимателей органами власти и должностными лицами.